Die installierten Pakete entsprechen den während der Installation ausgewählten Profilen, aber nicht notwendigerweise der tatsächlichen Verwendung des Rechners. Deshalb möchten Sie vielleicht ein Paket-Verwaltungsprogramm benutzen, um die Auswahl der installierten Pakete zu verfeinern. Die zwei am häufigsten verwendeten Programme (die bereits installiert sind, wenn das Profil „Desktop-Umgebung“ ausgewählt wurde) sind apt (über die Befehlszeile zu erreichen) und synaptic ("Synaptic-Paketverwaltung" in den Menüs).

Um die Installation von zueinander passenden Gruppen von Programmen zu erleichtern, erstellt Debian „Aufgaben“, die einem bestimmten Verwendungszweck dienen (Mailserver, Dateiserver, usw.). Sie hatten bereits die Möglichkeit, sie während der Installation auszuwählen, und Sie können sie erneut mit Paket-Verwaltungsprogrammen wie aptitude (die Aufgaben sind in einem besonderen Abschnitt aufgelistet) und synaptic (über das Menü Bearbeiten → Pakete nach Aufgaben vormerken) abrufen.

Aptitude ist eine Schnittstelle für APT im Vollbild-Textmodus. Sie ermöglicht es dem Nutzer, die Liste der verfügbaren Pakete nach verschiedenen Kategorien (installierte oder nicht installierte Pakete, nach Aufgabe, nach Bereich usw.) zu durchsuchen und die für jedes von ihnen verfügbare Information anzusehen (Abhängigkeiten, Konflikte, Beschreibung, usw.). Jedes Paket kann mit „installieren“ (um es zu installieren, die +-Taste drücken) oder „entfernen“ (um es zu entfernen, die --Taste drücken) gekennzeichnet werden. Alle diese Arbeitsgänge werden dann gleichzeitig ausgeführt, sobald Sie sie durch das Drücken der g-Taste („g“ für „go!“) bestätigt haben. Keine Sorge, falls Sie einige Programme vergessen haben; Sie können aptitude erneut benutzen, sobald die erste Installation beendet ist.

Of course, it is possible not to select any task to be installed. In this case, you can manually install the desired software with the apt or aptitude command (which are both accessible from the command line). The packages can be found using the apt-cache search task keyword command.

Ein erstes apt safe-upgrade (ein Befehl zur automatischen Aktualisierung der installierten Programme) ist normalerweise erforderlich, insbesondere für mögliche Sicherheitsaktualisierungen, die seit der Veröffentlichung der letzten stabilen Debian-Version herausgegeben wurden. Diese Aktualisierungen können einige zusätzliche Fragen durch debconf, Debians Standardkonfigurationsprogramm, stellen. Für weitere Informationen zu diesen von apt durchgeführten Aktualisierungen siehe Abschnitt 6.2.3, „Das System aktualisieren“.